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3株鴨乙型肝炎病毒全基因組克隆與序列分析

作者:王靜; 許鑫; 李宛玉; 王雪雨; 吳倩倩; 姚倫廣; 闞云超; 冀君 南陽師范學院/南陽市獸醫(yī)生物工程技術(shù)研究中心/南陽師范學院昆蟲生物反應(yīng)器河南省工程實驗室; 河南南陽473061

摘要:對河南南陽、安徽亳州、湖北潛江三地鴨血清樣本用PCR進行鴨乙型肝炎病毒(DHBV)檢測,并從三地經(jīng)檢測為DHBV陽性的樣本中各挑選1份進行DHBV全基因的擴增、克隆、測序及序列分析。結(jié)果顯示,河南南陽、安徽亳州、湖北潛江三地的鴨乙型肝炎自然感染率分別為17.6%、13.6%、16.1%,差異不顯著(P>0.05)。河南南陽、安徽亳州、湖北潛江3株DHBV基因組全長分別為3024、3027、3024bp,均含有編碼P、S和C蛋白的3個開放閱讀框。通過各開放閱讀框氨基酸同源性比較,發(fā)現(xiàn)編碼P蛋白的區(qū)域差異較大。全基因序列分析顯示,3株DHBV核苷酸同源性為95.1%~97.4%,與選取的25株參考株同源性為90.3%~96.2%。遺傳進化分析及P蛋白關(guān)鍵位點分析結(jié)果表明,3株均為類中國基因型,湖北潛江的DHBV毒株P(guān)蛋白3位-345位關(guān)鍵氨基酸殘基位點與中國毒株基因型相同,在367位-771位關(guān)鍵氨基酸殘基位點與西方毒株基因型相同,推測其產(chǎn)生了重組。結(jié)果表明,成功克隆了華中地區(qū)的3株鴨DHBV全基因序列,為DHBV的分子流行病學調(diào)查提供參考。

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