摘要:【目的】檢測從山東青島采集的有“花臉”癥狀的火焰海棠(Malus‘Flame’)果實是否帶有蘋果銹果類病毒(Apple scar skin viroid,ASSVd)?!痉椒ā刻崛в小盎槨卑Y狀的火焰海棠果皮總RNA,設計ASSVd特異性引物,利用RTPCR方法進行檢測。設計基因特異性引物擴增ASSVd基因組全長,并進行克隆、測序,利用CLC RNAWorkbench4預測其二級結構。用DANMAN軟件比對來自中國不同地區(qū)、不同寄主的蘋果銹果類病毒分離物基因序列。用MEGA-7軟件分析山東火焰海棠ASSVd分離物與來自不同國家、不同寄主ASSVd分離物的遺傳關系。【結果】從山東青島采集的表現(xiàn)“花臉”癥狀的火焰海棠果皮中檢測到ASSVd,推測火焰海棠果皮的“花臉”癥狀可能由ASSVd引起。利用基因特異性引物克隆4條ASSVd基因組全長序列,其長度為333~334 bp,在GenBank的登錄號依次為MK102981-MK102984。ASSVd序列比對結果顯示,來源于不同寄主的分離物存在差異。系統(tǒng)進化樹顯示ASSVd不存在明顯的地區(qū)?;?進一步對ASSVd二級結構分析發(fā)現(xiàn)不同寄主的ASSVd致病區(qū)(P)存在明顯的差異?!窘Y論】從山東青島采集的帶有“花臉”癥狀的火焰海棠果實帶有ASSVd。本研究從火焰海棠檢測到ASSVd,明確其為自然寄主之一,且火焰海棠果實的“花臉”癥狀形成可能與ASSVd侵染有關。
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