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親和純化技術(shù)聯(lián)合質(zhì)譜鑒定與S100A8和S100A9相互作用的蛋白

作者:王靜; 張學(xué)梅; 李征; 李夏雨; 馬健; 沈守榮 中南大學(xué)湘雅三醫(yī)院消化內(nèi)科; 長沙410013; 中南大學(xué)湘雅醫(yī)院湖南省非可控性炎癥與腫瘤重點實驗室; 長沙410013; 中南大學(xué)腫瘤研究所; 長沙410078; 中南大學(xué)高等研究中心高分辨質(zhì)譜實驗室; 長沙410078

摘要:目的:利用親和純化技術(shù)聯(lián)合質(zhì)譜分析篩選鑒定與S100A8和S100A9相互作用的蛋白,為探討S100A8和S100A9在結(jié)腸炎相關(guān)性結(jié)腸癌發(fā)生發(fā)展中的作用機制提供線索。方法:構(gòu)建含有S100A8和S100A9 CDS區(qū)和Flag親和標(biāo)簽的真核表達載體p3×Flag-CMV-S100A8和p3×Flag-CMV-S100A9,將其轉(zhuǎn)染至HEK293細(xì)胞中,48 h后收集蛋白。運用標(biāo)簽分離純化S100A8和S100A9蛋白,液相質(zhì)譜/質(zhì)譜分析技術(shù)(liquid chromatography mass spectrometry/mass spectrometry,LC-MS/MS)鑒定S100A8和S100A9的相互作用蛋白,通過生物信息學(xué)的方法(GO分析)歸納分析相互作用蛋白,免疫共沉淀實驗鑒定S100A8和S100A9的相互作用蛋白。結(jié)果:通過標(biāo)簽純化聯(lián)合質(zhì)譜分析成功鑒定出PKM,NPM1,e IF5A等14個與S100A8相互作用的蛋白,鑒定出14-3-3ε,PKM等6個與S100A9相互作用的蛋白。對所鑒定的相互作用蛋白進行生物信息學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)與S100A8和S100A9相互作用的蛋白參與糖代謝、細(xì)胞黏附、正向調(diào)控NF-κB轉(zhuǎn)錄因子活性、抗凋亡等在內(nèi)的生物信號通路,并利用免疫共沉淀證實PKM2與S100A8和S100A9發(fā)生相互作用,14-3-3ε與S100A9發(fā)生相互作用。結(jié)論:利用免疫共沉淀結(jié)合質(zhì)譜技術(shù)篩選鑒定的S100A8和S100A9相互作用蛋白PKM2和14-3-3ε,可能為闡明S100A8和S100A9在結(jié)腸炎相關(guān)性結(jié)腸癌發(fā)生發(fā)展中的作用機制提供重要線索。

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湖南醫(yī)科大學(xué)學(xué)報

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