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大鯢Agouti基因的克隆、表達(dá)及多態(tài)性分析

作者:姜維; 鄧捷; 王啟軍; 趙虎; 孔飛; 張紅星 陜西省動(dòng)物研究所; 陜西省秦嶺珍稀瀕危動(dòng)物保育重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 西安710032

摘要:刺鼠信號(hào)蛋白(Agouti)是哺乳動(dòng)物和鳥(niǎo)類黑色素合成過(guò)程中的重要調(diào)控因子,影響動(dòng)物的體色(毛色)。為研究Agouti在兩棲動(dòng)物體色形成過(guò)程中的作用,本研究利用PCR技術(shù)擴(kuò)增得到大鯢Andrias davidianus的Agouti基因部分cDNA序列并進(jìn)行了相關(guān)的生物信息學(xué)分析,進(jìn)一步使用實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)了大鯢Agouti基因在皮膚、肝臟等10個(gè)組織和器官中的表達(dá)情況,并檢測(cè)了4種不同體色大鯢皮膚組織中Agouti基因的表達(dá)量。同時(shí)采用直接測(cè)序法,比較了不同體色大鯢Agouti基因編碼區(qū)的序列差異。結(jié)果顯示,大鯢Agouti基因cDNA序列長(zhǎng)1 068 bp,開(kāi)放閱讀框399 bp,編碼132個(gè)氨基酸殘基。蛋白質(zhì)同源性分析表明,大鯢Agouti蛋白具有與其他物種一致的保守Agouti結(jié)構(gòu)域,其蛋白質(zhì)序列與兩棲爬行類序列相似性較高,與哺乳動(dòng)物和鳥(niǎo)類相似性較低。系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示,大鯢Agouti基因與高山倭蛙Nanorana parkeri、美國(guó)短吻鱷Alligator mississippiensis、中華鱉Pelodiscus sinensis等物種的親緣關(guān)系較近。實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析表明,Agouti基因mRNA在大鯢不同組織中均有表達(dá),皮膚中的表達(dá)量最高。在4種不同體色大鯢皮膚組織中,黃色皮膚中的Agouti基因表達(dá)量高于其他體色。不同體色大鯢Agouti基因編碼區(qū)序列一致。大鯢Agouti基因獨(dú)特的序列特征及其表達(dá)的組織特異性暗示了其在兩棲動(dòng)物體色形成過(guò)程中可能具有與其他物種不同的調(diào)控機(jī)制。這些結(jié)果為進(jìn)一步研究Agouti在大鯢體色形成過(guò)程中的作用提供了基礎(chǔ)資料。

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