計(jì)算生物學(xué)分析在基因組編輯研究中的應(yīng)用
作者：王瀅; 熊義春; 陳佳; 楊力 中國(guó)科學(xué)院計(jì)算生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、中國(guó)科學(xué)院-德國(guó)馬普學(xué)會(huì)計(jì)算生物學(xué)伙伴研究所、中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院營(yíng)養(yǎng)與健康研究院; 中國(guó)科學(xué)院大學(xué); 上海200031; 上海科技大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院; 上海200031
摘要：基因組編輯是對(duì)基因組遺傳信息進(jìn)行定向改造的技術(shù),其中CRISPR/Cas系統(tǒng)是目前應(yīng)用最廣泛的基因組編輯新技術(shù)。將先進(jìn)的高通量測(cè)序以及相關(guān)計(jì)算生物分析應(yīng)用于基因編輯研究,可進(jìn)一步優(yōu)化基因編輯效率和精度等檢測(cè)流程,實(shí)現(xiàn)對(duì)全基因組功能基因篩選的監(jiān)測(cè)。同時(shí),利用基于生物信息及機(jī)器學(xué)習(xí)和深度學(xué)習(xí)等新方法,可對(duì)向?qū)NA(gRNA)的高效設(shè)計(jì)和實(shí)現(xiàn)對(duì)編輯效果的預(yù)測(cè)。本文將對(duì)計(jì)算生物學(xué)分析在CRISPR/Cas基因編輯系統(tǒng)的應(yīng)用及研究進(jìn)展等進(jìn)行概述。
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