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琥珀酸對酵母細胞轉錄組的影響

作者:THEKRA; Khushafa; 童僑; 范磊; 劉雪飛; 黃新河 西南交通大學生命科學與工程學院; 成都610031

摘要:尋找抗衰老活性小分子并研究其作用機制是衰老藥物學研究的重點和熱點。本文報道了一種新的抗衰老活性小分子琥珀酸,發(fā)現(xiàn)琥珀酸可以顯著延緩芽殖酵母細胞的衰老并增強細胞的壓力抗性。隨后,利用DNA Microarray技術及生物信息學手段較系統(tǒng)分析了琥珀酸處理對基因表達譜、基因本體聚類及相關信號通路的影響。結果顯示,琥珀酸處理對細胞轉錄組產(chǎn)生了顯著影響,共導致3 485個基因的差異表達(P〈0.05),其中1 335個基因顯著上調,2 150個基因顯著下調。進一步對基因本體聚類及信號通路分析顯示,線粒體及核糖體生物合成相關的分子功能、細胞組分、生物學過程和信號通路可能是琥珀酸作用的主要靶點,其他可能的作用靶點還包括蛋白酶體、細胞內吞、過氧化物酶體代謝及細胞自噬等。本研究為進一步闡明琥珀酸介導的壽命及壓力調控機制提供了理論參考和研究線索。

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生物信息學

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