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玉米鄰甲基轉(zhuǎn)移酶基因bx12-ZaC546的克隆及其生物信息學(xué)分析

作者:史娟娟; 馮賀; 劉恩卓; 李鵬; 鄭大浩 延邊大學(xué)農(nóng)學(xué)院; 吉林延吉133002

摘要:鄰甲基轉(zhuǎn)移酶是與玉米抗蟲性密切相關(guān)的苯并噁嗪類化合物生物合成中的關(guān)鍵酶之一,由bx12基因編碼。為深入研究bx12基因的表達(dá)與調(diào)控機(jī)理,該研究從我國玉米自交系ZaC546中克隆出了含有目的基因bx12的目標(biāo)DN段Zm3325-ZaC546。測序結(jié)果證明:從ZaC546基因組中分離的目標(biāo)DNA序列長度為1010bp,含有完整的開放閱讀框(ORF)。與玉米基因組數(shù)據(jù)庫上的參考序列相比,目標(biāo)DNA序列在其ORF的內(nèi)部,從起始密碼子的第1個堿基開始,下游第204個堿基位置上存在1個堿基突變,由G突變?yōu)锳,遺傳密碼由AAG變?yōu)锳AA,但氨基酸不變,都編碼賴氨酸(Lysine,K)。雖然,目標(biāo)DNA序列在其ORF的下游,第883個堿基G發(fā)生缺失,第905個堿基由T突變?yōu)镃,但因這2個突變位于ORF的下游,并不影響目的基因的編碼活性。目標(biāo)DNA序列Zm3325-ZaC546與參考序列的一致性為99.70%,閱讀框序列的一致性為99.87%;而由目的基因編碼的蛋白質(zhì)氨基酸序列與參考序列的一致性為100%。生物信息學(xué)分析結(jié)果表明:本研究中克隆的基因所編碼的鄰甲基轉(zhuǎn)移酶蛋白屬于鄰甲基轉(zhuǎn)移酶基因超級家族2。該酶是一種多功能酶,具有2個大的結(jié)構(gòu)域,一個位于N-末端一側(cè),具有甲基轉(zhuǎn)移酶蛋白二聚化功能;另一個位于C-末端一側(cè),具有甲基轉(zhuǎn)移酶功能和鄰甲基轉(zhuǎn)移酶功能。

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延邊大學(xué)農(nóng)學(xué)學(xué)報(bào)

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