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樹鼩BACE1全長(zhǎng)編碼序列的克隆及分子特征分析

作者:苗雨潤(rùn); 李明學(xué); 李娜; 王文廣; 匡德宣; 仝品芬; 孫曉梅; 罕園園; 陸彩霞; 代解杰 中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院/北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)生物學(xué)研究所樹鼩種質(zhì)資源中心; 昆明650118

摘要:目的獲取樹鼩β-淀粉樣前體蛋白切割酶BACE1(beta-site APP cleaving enzyme-1)的全長(zhǎng)編碼序列并進(jìn)行分子特征分析,為開展AD疾病的機(jī)制研究提供依據(jù)。方法提取樹鼩大腦及其他臟器組織總RNA,通過RACE(rapid-amplification of cDNA ends)實(shí)驗(yàn)得到的序列與中間序列進(jìn)行拼接得到樹鼩BACE 1全長(zhǎng)編碼序列,使用DNAMAN、MEGA 10.0.5、PyMOL等生物信息學(xué)軟件,對(duì)其序列和分子特征進(jìn)行分析。結(jié)果樹鼩BACE 1除在腦組織表達(dá)外,在外周組織也有表達(dá)。樹鼩BACE 1核酸序列和蛋白質(zhì)分子整體結(jié)構(gòu)與人類高度相似,樹鼩與人類的BACE1蛋白在膜內(nèi)結(jié)構(gòu)區(qū)均存在一個(gè)高度保守的DXXLL的ACDL分選內(nèi)吞基序,兩者具有相同的胞外域、跨膜域及胞內(nèi)域,但樹鼩BACE1蛋白質(zhì)相比人少一個(gè)潛在的乙?;稽c(diǎn),并且在折疊結(jié)構(gòu)上存在差異。結(jié)論本研究獲得樹鼩BACE 1基因完整編碼序列,其蛋白基本結(jié)構(gòu)與人的基本相似,提示樹鼩可能是作為研究AD病理改變或藥物研究潛在的理想模型。

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