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2013-2017年我國小反芻獸疫病毒H基因分子演化特征

作者:劉春菊; 盛琰翔; 王清華; 遲田英; 朱琳; 王英麗; 馬洪超; 王志亮; 包靜月 中國動(dòng)物衛(wèi)生與流行病學(xué)中心; 山東青島266032; 浙江農(nóng)林大學(xué); 浙江臨安311300

摘要:為研究我國小反芻獸疫病毒(PPRV)的分子流行特點(diǎn),對(duì)2013—2017年我國37株P(guān)PRV流行毒株進(jìn)行血凝蛋白(H)基因序列測(cè)定和生物信息學(xué)分析。結(jié)果顯示:37個(gè)毒株H基因核苷酸序列之間的遺傳距離為0~0.0077,變異分布在41個(gè)位點(diǎn),H蛋白氨基酸序列之間的遺傳距離為0~0.0132,變異分布在24個(gè)位點(diǎn)。與15株代表毒株進(jìn)行序列比對(duì)發(fā)現(xiàn),2013-2017年我國37株P(guān)PRV流行毒株H基因的13個(gè)位點(diǎn)發(fā)生了核苷酸序列突變,其中9個(gè)導(dǎo)致了氨基酸序列的改變。以最大似然法構(gòu)建分子進(jìn)化樹,發(fā)現(xiàn)2013-2017年我國流行的37個(gè)毒株構(gòu)成基因4系中一個(gè)獨(dú)立的進(jìn)化小分支。本研究闡明了2013-2017年我國PPRVH基因的分子演化特征,從而為該病控制和消滅策略的制定提供了數(shù)據(jù)支持。

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