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靶向果蠅Kr-h1基因的mi RNA預(yù)測及其生物信息學(xué)分析

作者:董文韜; 楊卓妮娜; 何倩毓; 劉勝軍 黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)動物科技學(xué)院; 黑龍江大慶163319

摘要:目的預(yù)測靶向果蠅Kr-h1(Krǜppel homolog1)基因的miRNA,并對其生物學(xué)功能及相關(guān)生物信息學(xué)進行分析,為進一步研究miRNA通過調(diào)控Kr-h1的表達而參與保幼激素(juvenile hormone,JH)對果蠅變態(tài)發(fā)育的調(diào)控奠定基礎(chǔ)。方法通過microT-CDS、Targetscan和miRanda在線預(yù)測網(wǎng)站,對靶向Kr-h1基因的miRNA進行預(yù)測,對預(yù)測得到的多個miRNA按靶向結(jié)合可能性的大小進行匯總,3個網(wǎng)站均能預(yù)測到的miRNA為交集miRNA,對交集miRNA的靶基因及Kr-h1基因進行生物信息學(xué)功能分析。結(jié)果 microT-CDS、Targetscan和miRanda分別預(yù)測到30、7和11個靶向Kr-h1的miRNA,其中交集miRNA有4個,為miR-8、miR-277、miR-927和miR-964。功能分析發(fā)現(xiàn),交集miRNA的靶基因主要參與細胞過程、生物過程和代謝過程,Kr-h1基因主要與昆蟲生長發(fā)育及生殖相關(guān)。結(jié)論潛在靶向Kr-h1的miRNA涉及多個生物學(xué)過程,與昆蟲的生長發(fā)育密切相關(guān)。

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中國生物制品學(xué)

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