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基于氧化苦參堿相似化合物的UQCRB抑制劑的虛擬篩選

作者:鄭丹娜; 孫硯輝; 伍志學(xué); 張韌; 吳紹鋒 廣州中醫(yī)藥大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院; 廣東廣州51006

摘要:目的通過(guò)構(gòu)建輔酶Q-細(xì)胞色素C還原酶結(jié)合蛋白(UQCRB)小分子抑制劑的藥效團(tuán)模型,對(duì)相似的氧化苦參堿化合物庫(kù)進(jìn)行虛擬篩選,尋找出UQCRB小分子抑制劑,為抗腫瘤藥物的篩選奠定基礎(chǔ)。方法使用Discovery Studio 2.5軟件進(jìn)行藥效團(tuán)模型的構(gòu)建。首先使用具有活性預(yù)測(cè)能力的Hypogen算法構(gòu)建出UQCRB小分子抑制劑藥效團(tuán)模型,再運(yùn)用Ligand Profiler模塊驗(yàn)證藥效團(tuán)模型,應(yīng)用篩選出來(lái)的最佳藥效團(tuán)模型對(duì)氧化苦參堿相似化合物數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行虛擬篩選,再進(jìn)行分子對(duì)接驗(yàn)證以及ADMET預(yù)測(cè)。結(jié)果應(yīng)用Hypogen算法成功構(gòu)建了具有最佳的活性和非活性分子識(shí)別能力的藥效團(tuán)模型,并篩選出了9個(gè)具有潛在活性的氧化苦參堿相似化合物。結(jié)論本研究為發(fā)現(xiàn)UQCRB小分子抑制劑提供了新思路。

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中藥新藥與臨床藥理

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